O Conselho Nacional é o órgão que no intervalo entre as sessões do Congresso está dotado de poderes deliberativos e tem a seguinte composição: (a) Mesa do Congresso; (b) os membros do Conselho Fiscal; (c) um Presidente de Conselho Municipal por província; (d) um Presidente da Assembleia Municipal por província.

São competências do Conselho Nacional: (i) aprovar o seu Regimento; (ii) definir e convocar periodicamente sessões especializadas de trabalho, para debate de questões com interesse para o poder local e para a ANAMM; (iii) aprovar os Planos Anuais de Actividades e Orçamentos; (iv) aprovar o relatório anual de actividades e de contas; (v) aprovar a contratação de empréstimos; (vi) aprovar a proposta de Estrutura Orgânica e dos serviços da Associação; (vii) deliberar sobre a suspensão da qualidade de membro da ANAMM; entre outras competências previstas nos estatutos.